對存貨赤字的處理，取決于存貨赤字余額的性質(zhì)，在查明存貨赤字原因及其性質(zhì)的前提下，一般可遵循以下原則處理：
　　1、屬于供貨方錯發(fā)（多發(fā)）的存貨，應(yīng)當(dāng)與對方協(xié)商解決，退貨或作價付款。
　　2、屬于錯賬的，應(yīng)調(diào)賬處理；屬于購貨后未及時辦理入賬手續(xù)和升溢未及時報告處理導(dǎo)致賬務(wù)處理不及時的，應(yīng)補(bǔ)記入賬。因錯賬或入賬不及時產(chǎn)生的盈虧不實(shí)，經(jīng)調(diào)賬后新增的利潤（或虧損），應(yīng)按稅法規(guī)定調(diào)整企業(yè)所得稅納稅申報。
　　3、屬于各類違紀(jì)違規(guī)問題，必須依據(jù)法律法規(guī)進(jìn)行處理和處罰。

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